农民发生种子纠纷可按照以下流程打官司：
1、确定纠纷的管辖，收集相关的证据并写好起诉状；
2、携带诉讼所需的相关资料到人民立案庭立案；
3、人民受理后，缴纳诉讼费用；
4、按照通知参加庭审；
5、等待判决。
种子质量问题时进行维权方式如下：
1、收集保存证据。购种时应注意收集、保存购种或购种凭证、种子包装袋和未拆封的剩余种子等证据；
2、出了问题，及时告知种子经营者。出现问题后，及时联系种子销售商或生产经营企业，告知出现的问题，要求实地查看，并解决问题；
3、种子经营者不解决，向当地县级农业农村部门投诉。种子销售商、生产经营企业不予解决或推脱时，应携带有关证据向当地县级农业农村部门反映情况，要求解决问题；
4、寻找技术支持，分清责任。在难以分清田间质量纠纷责任的情况下，农民朋友可单独、也可与种子销售商或生产经营企业共同向当地县级种子技术部门提出田间现场鉴定申请，并缴纳鉴定费用；
5、也可走司法途径解决。农业农村部门可以依据鉴定结论对种子质量纠纷予以协调和处理。农民朋友也可以直接向人民起诉解决。
【法律依据】：
《中华人民共和国民事诉讼法》第一百二十三条
起诉应当向人民递交起诉状，并按照被告人数提出副本。
书写起诉状确有困难的，可以口头起诉，由人民记入笔录，并告知对方当事人。
第一百二十九条
人民对决定受理的案件，应当在受理案件通知书和应诉通知书中向当事人告知有关的诉讼权利义务，或者口头告知。
